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    近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所芝麻與特色油料遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在國(guó)際知名學(xué)術(shù)刊物《核酸研究（Nucleic Acids Research）》發(fā)布了植物微衛(wèi)星DNA及其標(biāo)記開(kāi)發(fā)數(shù)據(jù)庫(kù)PMDBase。該數(shù)據(jù)庫(kù)的創(chuàng)建和共享將為全球作物功能基因組學(xué)和分子育種研究提供全面的、便利的基礎(chǔ)平臺(tái)。
    微衛(wèi)星DNA，也稱(chēng)為SSR，是涉及許多重要生物功能的基因組成分，已被廣泛地應(yīng)用于作物基礎(chǔ)研究，包括遺傳多樣性、連鎖和關(guān)聯(lián)作圖、標(biāo)記輔助選擇、品種鑒定和進(jìn)化分析等。
    據(jù)介紹，該團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一套便捷高效的微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)鑒定及分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)流程，對(duì)截至目前已完成基因組測(cè)序的110個(gè)植物進(jìn)行了鑒定，已發(fā)掘微衛(wèi)星DNA位點(diǎn) 超過(guò)2600萬(wàn)個(gè)，并為每個(gè)位點(diǎn)開(kāi)發(fā)了3對(duì)引物。用戶(hù)可獲取目標(biāo)物種有用的微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)和引物信息，以及每個(gè)位點(diǎn)所屬物種、位置、起止、類(lèi)型、大小以及序列信息。用戶(hù)可以利用數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)在線鑒定及分子標(biāo)記在線設(shè)計(jì)。該數(shù)據(jù)庫(kù)還提供了多種檢索方式和下載功能，所有數(shù)據(jù)和分析結(jié)果都可下載。
    該數(shù)據(jù)庫(kù)為全球研究者們提供了在線的、友好的、便利的植物微衛(wèi)星DNA鑒定平臺(tái)，同時(shí)還整合了在線微衛(wèi)星DNA鑒定網(wǎng)絡(luò)服務(wù)，是目前國(guó)際上涵蓋最多植物物種和信息最全面的綜合性數(shù)據(jù)庫(kù)，填補(bǔ)了同領(lǐng)域相關(guān)研究空白。
    該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)農(nóng)科院創(chuàng)新工程和所長(zhǎng)基金等項(xiàng)目的支持。芝麻與特色油料遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)的于景印博士為論文第一作者，團(tuán)隊(duì)首席張秀榮研究員為論文通訊作者。