近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護研究所農(nóng)業(yè)入侵生物預(yù)防與監(jiān)控創(chuàng)新團隊聯(lián)合國內(nèi)有關(guān)科研單位，首次完成南亞果實蠅染色體水平參考基因組組裝，并對其進行了結(jié)構(gòu)和功能注釋。該研究填補了南亞果實蠅基因組數(shù)據(jù)的空白，對了解其遺傳學(xué)、生態(tài)學(xué)和進化學(xué)具有重要意義，也為南亞果實蠅及其他近緣物種的科學(xué)防控提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《科學(xué)數(shù)據(jù)（Scientific Data）》上。
南亞果實蠅是多食性農(nóng)業(yè)害蟲，危害多種經(jīng)濟作物，近年來其分布范圍不斷擴張，對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成巨大危害。為得到高質(zhì)量基因組，研究人員首先構(gòu)建了南亞果實蠅的實驗室種群，經(jīng)過9代近交降低雜合度后，采用單分子測序技術(shù)結(jié)合染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)，組裝得到421.79兆（Mb）基因組。共鑒定了20922個蛋白質(zhì)編碼基因，其中17251個基因同時被功能注釋。經(jīng)評估，基因組組裝完整度為99.7%，注釋完整度為97.6%。這一高質(zhì)量參考基因組將為進一步研究南亞果實蠅的環(huán)境適應(yīng)性和入侵機制提供研究基礎(chǔ)。
該研究得到國家重點研發(fā)計劃等項目的支持。（通訊員：郭建英）
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