10日，記者從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉，該院飼料研究所水產(chǎn)微生物與飼料創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)成功構(gòu)建了首個(gè)草魚腸道微生物基因目錄。該成果日前發(fā)表于國(guó)際期刊《微生物組》。
腸道菌群在魚類的新陳代謝過(guò)程和免疫系統(tǒng)運(yùn)作中扮演著關(guān)鍵角色，但目前對(duì)于魚類腸道微生物基因組的認(rèn)知仍然相當(dāng)有限。
“研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用了宏基因組學(xué)技術(shù)，成功構(gòu)建了包含57.6萬(wàn)個(gè)基因的非冗余草魚腸道微生物基因目錄，并對(duì)這些基因進(jìn)行了詳盡分類與功能注解。這一成果為我們深入理解魚類腸道微生物的復(fù)雜生態(tài)系統(tǒng)提供了工具?！闭撐墓餐ㄓ嵶髡摺⒅袊?guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院飼料研究所研究員周志剛告訴科技日?qǐng)?bào)記者。
研究進(jìn)一步解析了草魚腸道微生物組的主要互作模式和功能特征。“我們發(fā)現(xiàn)草魚腸道微生物存在兩個(gè)功能群。這兩個(gè)功能群在生態(tài)學(xué)上呈互斥模式，并且在碳水化合物利用、毒力因子和抗生素耐藥性基因等方面均表現(xiàn)出顯著的遺傳能力差異。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，兩個(gè)功能群之間的比值能夠有效地反映出草魚在不同飲食條件下的腸道微生物群落的構(gòu)成和功能特性。因此，這一比值可以作為一個(gè)指標(biāo)，用于評(píng)估魚類腸道菌群的穩(wěn)定性狀態(tài)?！敝苤緞傉f(shuō)。
該研究擴(kuò)充了魚類腸道微生物的基因目錄資源，揭示了魚類腸道菌群主要門類的功能特征，為腸道菌群的調(diào)控提供了潛在的靶點(diǎn)?！拔覀兯鶚?gòu)建的基因目錄為深入研究草魚腸道微生物組提供了基因資源。通過(guò)多種組學(xué)分析，我們能夠更全面地理解魚類微生物群中的主要門類所扮演的角色，進(jìn)而發(fā)現(xiàn)調(diào)控這些微生物群的關(guān)鍵靶點(diǎn)?！敝苤緞傉f(shuō)。
