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    本報(bào)訊 近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所研究員李世訪研究團(tuán)隊(duì)與中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)吳清發(fā)教授研究團(tuán)隊(duì)合作，在世界上首次發(fā)現(xiàn)蘋果中存在具有核酶活性的環(huán)狀RNA。

    上世紀(jì)80年代，在研究蘋果上一種危害嚴(yán)重的病害——蘋果銹果病時(shí)，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院興城果樹研究所的果樹病毒專家劉福昌研究員和日本果樹病毒專家小金澤碩城均從蘋果中分離到一種特殊環(huán)狀RNA。但是，限于檢測及分析技術(shù)的限制，一直未能揭示出它的真面目。

    2012年，在一次國際會議中，李世訪結(jié)識了專門從事生物信息學(xué)研究的吳清發(fā)，并決定共同探究蘋果中環(huán)狀RNA的真面目。

    研究團(tuán)隊(duì)采用了高通量測序（NGS）技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)分析的策略。他們重新編譯了PFOR2程序，其運(yùn)行速度比PFOR提高了3~8倍，從而能夠處理高通量測序獲得的大量數(shù)據(jù)。通過對含有環(huán)狀RNA的蘋果銹果樣品進(jìn)行高通量測序，經(jīng)過幾個(gè)月的摸索和反復(fù)驗(yàn)證，終于拿到了該環(huán)狀RNA的全序列。

    序列分析發(fā)現(xiàn)，該環(huán)狀RNA由434個(gè)核苷酸組成，是一種迄今為止從未見過報(bào)道的新的環(huán)狀RNA。自中國報(bào)道后，美國、意大利等國研究人員的檢測結(jié)果也為此提供了有力的佐證。有意思的是，生化實(shí)驗(yàn)表明，該環(huán)狀RNA正、負(fù)鏈均具有核酶活性，能夠進(jìn)行自我剪切。該研究為今后從植物和動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)更多環(huán)狀RNA提供了新的思路和技術(shù)手段。