被測(cè)序的大蒜品種二水早紫皮蒜 麻類(lèi)所供圖
7月27日,《分子植物》(Molecular Plant)在線(xiàn)發(fā)表首個(gè)染色體水平大蒜基因組圖譜。被測(cè)序的大蒜品種是二水早紫皮蒜,其適用性廣,在我國(guó)種植地域最廣。這項(xiàng)成果由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類(lèi)研究所(以下簡(jiǎn)稱(chēng)麻類(lèi)所)南方蛋白飼料植物資源開(kāi)發(fā)與利用團(tuán)隊(duì)聯(lián)合有關(guān)高校和企業(yè),歷時(shí)4年完成。
論文通訊作者、麻類(lèi)所研究員劉頭明介紹,大蒜是重要的蔬菜作物之一,我國(guó)大蒜的年播種面積達(dá)到1000萬(wàn)畝以上。大蒜具有膨大的鱗莖,富含大蒜素,不僅可用作蔬菜和調(diào)味料食品,也被廣泛用于醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)。但栽培種大蒜一般不育,嚴(yán)重阻礙了大蒜生物學(xué)研究及大蒜育種工作。
大蒜基因組龐大且復(fù)雜,具有重復(fù)序列高、雜合度大等特點(diǎn)。研究發(fā)現(xiàn),基于基因組系統(tǒng)進(jìn)化分析,大蒜與天門(mén)冬目石蒜科物種親緣關(guān)系最近,并推斷大蒜的3次全基因組復(fù)制事件及重復(fù)序列急劇擴(kuò)張是驅(qū)動(dòng)大蒜基因組龐大的根本原因。
大蒜素是蔥屬作物中特有的化合物。該研究通過(guò)基因組擴(kuò)張收縮分析,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),確立了大蒜素生物合成通路。
作為首個(gè)蔥屬物種中完成測(cè)序的基因組,大蒜基因組測(cè)序組裝工作的完成對(duì)于研究物種進(jìn)化具有重要的意義。
該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、中國(guó)農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程和國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目資助。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1016/j.molp.2020.07.019